Emilie Barbosa, étudiante de Master à Toulouse, a réalisé son stage de fin d’études au GMB sur la mise à jour d’un référentiel d’activité des chauves-souris bretonnes, et la restructuration des procédures de collecte et d’archivage des enregistrements passifs de l’association, désormais intégrés au protocole Vigie Chiro déployé par nos partenaires du Muséum National d’Histoire Naturelle.
Résumé :
La biodiversité subit de nombreuses pressions anthropiques qui ont amené à un déclin généralisé et continu des espèces (Van Goethem et Van Zanden, 2021). De nos jours, ce déclin ne semble pas ralentir et les pressions s’accentuent. En France, l’artificialisation des sols et les changements de pratiques agricoles ont conduit à des modifications des paysages et des systèmes écologiques par la fragmentation des milieux naturels. Les Chiroptères représentent des espèces bioindicatrices qui peuvent être témoin de la qualité d’un habitat à un instant t, mais aussi être indicatrices de modifications naturelles et/ou artificielles sur le court, moyen et long terme car elles sont sensibles à ces perturbations (Barré et al., 2021 ; Kervyn, 2001).
Les référentiels d’activité acoustique constituent une méthode de suivi standard des Chiroptères, un indicateur de la biodiversité et de la qualité des habitats et permettent de hiérarchiser des enjeux de conservation. Ils peuvent donc servir de base à une meilleure prise en compte des chauves-souris par les gestionnaires d’espaces naturels, les services instructeurs ou les bureaux d’étude.
Le Groupe Mammalogique Breton effectue des relevés acoustiques depuis 2013. De fait, de nombreuses données sont disponibles grâce aux divers protocoles d’études mis en place. Ayant la volonté d’approfondir les connaissances sur les chiroptères bretons, un référentiel d’activité acoustique régional par espèce a été construit. Les données utilisées sont transmises par le Muséum National d’Histoire Naturelle, qui utilise le logiciel d’identification automatique Tadarida. Ce logiciel est utilisable utilisable via l’interface du programme Vigie-Chiro. Un ensemble de variables environnementales a été testé pour réduire le jeu de données afin de définir des conditions d’application au sein desquelles le référentiel serait robuste. Des analyses météorologiques à partir des bases de données accessibles en ligne ont permis d’affiner la justesse du référentiel. Ce nouvel outil est spécifique et saisonnier. Dans le même temps, la base de données acoustique traitée sous Microsoft Access du Groupe Mammalogique Breton a été restructurée pour permettre à l’association d’archiver ses données sur le long terme.
Ce rapport permet d’exposer une nouvelle approche dans l’élaboration d’un référentiel d’activité acoustique. De manière plus générale, l’utilisation des données issues du protocole Vigie-Chiro permet de rendre cohérentes les études effectuées à l’échelle régionale et nationale, voire internationale. Il est d’autant plus important de combiner ces différentes échelles pour comprendre et identifier les enjeux de conservation des populations de chiroptères. Ce référentiel pourrait être accompagné d’un indice de rareté basé sur l’occurrence des espèces (Haquart, 2013). De plus, un projet est en cours de réalisation avec l’association Bretagne Vivante afin d’étudier les effets du climat et de la naturalité sur l’activité des chauves-souris bretonnes.
